Risorse per lo studio e la ricerca in ambito Biomedico: PUBMED

• L'interrogazione può essere effettuata nel linguaggio naturale, che verrà tradotto automaticamente dal sistema in una formula di ricerca più ampia;
• Il criterio della pertinenza (Best Match) è l'opzione di default per l'ordinamento dei risultati, che è comunque sempre modificabile se si preferisce quello per data (Most Recent);
• Tra i risultati della ricerca sono inclusi gli snippets, frammenti di testo ripresi dall'abstract dell'articolo in cui sono evidenziati in grassetto i termini inseriti nella stringa di ricerca oltre ad eventuali sinonimi e termini affini;
• E’stata potenziata la ricerca dei sinonimi, delle varianti dei termini (es. ricerca di singolari e plurali senza la necessità di utilizzare troncamenti);
• Migliorata la mappatura dei terimini in British English e American English;
• La ricerca è più intuitiva e affidabile;
• L’interfaccia è stata adattata ai dispositivi mobili

La ricerca in PubMed si è semplificata notevolmente con la nuova interfaccia.

Per effettuare una ricerca partendo dalla stringa di ricerca principale occorre:

• Identificare i concetti chiave della ricerca
• Inserire il o i termini o i concetti chiave nella «Search box»
• Avviare la ricerca col tasto Search

IMPORTANTE:

Non è necessario inserire punteggiatura, tags, operatori booleani, o caratteri di troncamento (es.*).

In molti casi non è necessario utilizzare una particolare sintassi, PubMed infatti utilizza alcuni strumenti per recuperare i risultati più rilevanti:
Il Best Match ordina i risultati secondo un algoritmo per mettere al primo posto dell’elenco quelli che sono più rilevanti.
E inoltre presente una funzione di «autocompletamento» per fornire dei suggerimenti partendo dalle parole inserite. E’ presente anche una funzione che suggerisce dei termini corretti in caso di errore di scrittura.

COME LIMITARE I RISULTATI IN PUBMED

Se si recuperano troppi risultati si può intervenire in diversi modi:

• Sostituire il termine ricercato con uno più specifico (es. "Low back pain" invece di "Back pain");
• Includere altri termini assieme al termine ricercato;
• Usare i filtri presenti nella barra laterale a sinistra;
• Usare i qualificatori dei MESH Terms  (es. Headache/drug therapy)

COME AUMENTARE I RISULTATI IN PUBMED

Se i risultati sono troppo pochi si può:

• Utilizzare la funzione «Similar Articles» presente tra i dettagli del record;
• Rimuovere termini estranei, troppo specifici dalla Search box;
• Usare termini alternativi per descrivere il concetto che si sta cercando.

Per limitare il numero di risultati ottenuti è possibile utilizzare i Filtri, "Filters", presenti nella barra di navigazione a sinistra.
I filtri sono raggruppati per categorie:

• Disponibilità del testo - TEXT AVAILABILITY (es. free full-text, abstract);
• Tipologia di articolo - ARTICLE TYPE (es. Review, Clinical Trial, ecc...);
• Data di pubblicazione - PUBLICATION DATE

Se si desidera aggiungere nuove categorie di filtri occorre selezionare la funzione "Additional filters". Si possono cosi' aggiungere ulteriori filtri  quali:

• tipologie di pubblicazione, (ad es: Practice guideline, Validation Study, Clinical trial, ecc..);
• specie (umane o animali);
• lingua di pubblicazione;
• sesso;
• soggetti (es. AIDS, Cancer, ecc.);
• tipologie di riviste (Dental Journals, Nursing Journals, ecc.);
• fasce di età (es. Child, Adolescent, Aged, ecc...).

Con il pulsante "Reset filters" è possibile ritornare alla configurazione di default.

​SALVARE I RISULTATI

Una volta ottenuto un elenco di record bibliografici dalla ricerca, è possibile salvarli tutti o una selezione, utilizzando la funzione CLIPBOARD. I record salvati in questa cartella restano sul server fino a 8 ore di inattività, dopo le quali vengono cancellati. Creando un account in "MY NCBI" è possibile salvarli definitivamente.

CITARE UN DOCUMENTO

Per citare un documento è presente nella parte inferiore del record bibliografico la funzione "Cite", con la quale si puo’ salvare la citazione scegliendo anche tra diversi stili citazionali. Utilizzando il bottone «Cite» apparirà un popup dove è presente la citazione bibliografica e le diverse funzioni disponibili, come Copy, Download e Format.

CONDIVIDERE UN RECORD

Per condividere un record si puo’ utilizzare la funzione "Share" e postarla sui principali social quali Facebook o Twitter o copiare automaticamente il link relativo al record e inviarlo ad es. per email o incollarlo in un documento word.

La visualizzazione dei record è personalizzabile.

Sorted by (Ordinamento per)

Di default i record sono visualizzati in ordine di «Best match» (quelli più pertinenti all'argomento), ma è possibile utilizzare altre opzioni quali "Most recent" (cioè quelli aggiunti recentemente nel database) o "Publication date" (ordinati per data di pubblicazione dell'articolo).

Format (Formato del record)

Di default i record sono visualizzati nel formato "Summary", che mostra oltre al titolo anche gli autori, il riferimento bibliografico, il PMID  e una breve porzione dell'abstract. Selezionando il formato "Abstract" viene visualizzato il riassunto per intero se è disponibile e altri elementi del record quali le Keywords, il link alle citazioni bibliografiche, agli articoli che lo citano, ai termini MESH, il tipo di pubblicazione, e il link al full-text.

Per page

Di default i record vengono visualizzati 10 per pagina. E' possibile scegliere un n. maggiore di record selezionando  tra le opzioni presentate nel menu "Per page"  ad es. 20, 50, 100 o 200.

E' possibile ricercare un termine in un campo specifico (Field), come ad es. campo "autore" o "titolo di rivista" o "titolo dell'articolo". Per alcuni campi si attiva la funzione di autocompletamento. Per selezionare il campo in cui ricercare il termine occorre aprire il menu a tendina e selezionare il campo, es. "Title". Una volta selezionato aggiungere il termine nella "Query box" (Stringa di ricerca).
Una volta aggiunto il termine necessario per costruire la strategia di ricerca, cliccare sul tasto "Add". Nella Query box avviare la ricerca col pulsante "Search".
E' possibile definire il campo in cui cercare il termine aggiungendo accanto alla parola il relativo "tag" (etichetta) tra parentesi quadre. Ad esempio se si intende ricercare tutti gli articoli in cui è presente la parola "spine" nel "titolo" si può costruire la query scrivendo spine[TI].

Le ricerche possono essere combinate tra loro selezionando la funzione "Advanced"  presente nella homepage di PubMed sotto la stringa di ricerca principale. Si aprirà la pagina contenente lo strumento di ricerca avanzata o "PubMed Advanced Search Builder" e il prospetto delle ricerche effettuate nella sessione di lavoro o "History and Search Details".

Per abbinare due o più ricerche presenti nella tabella "History and Search Details" aprire il menu con i tre puntini accanto ad una ricerca, e scegliere tra le voci presenti "Add query": la ricerca verrà riportata nella "Query box". Per abbinare questa ricerca ad un'altra, posizionarsi sulla riga corrispondente alla ricerca che si vuole abbinare, selezionare  tra le funzioni disponibili che si aprono cliccando sul simbolo dei tre puntini, una delle seguenti voci: "Add with AND", "Add with OR", "Add with NOT". Le ricerche possono a questo punto essere abbinate tra loro utilizzando il pulsante "Search" presente nella "Query box".
E' possibile utilizzare i numeri identificativi delle ricerche per abbinarle, digitandoli direttamente nella Query box utilizzando il simbolo del cancelletto accanto al numero della ricerca es.#3 e l'operatore booleano appropriato, es. #20 AND #18. E' importante che la sintassi sia precisa, quindi utilizzare il simbolo # e il n. identificativo della ricerca senza spazi. Utilizzare inoltre l'operatore booleano in maiuscolo.

Le citazioni salvate nella Clipboard sono contrassegnate dal numero #0 e possono essere utilizzate negli abbinamenti.